MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 3064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017285	AGA	2	6	30	35	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017285	CAG	2	6	46	51	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017285	GAA	2	6	1006	1011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017285	A	6	6	1013	1018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017285	TTCA	2	8	2466	2473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017285	CAT	2	6	2931	2936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017285	TAT	2	6	2944	2949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017285	ATT	2	6	2962	2967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017285	CAA	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017285	TTG	2	6	5234	5239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017285	A	6	6	5275	5280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017285	AATC	2	8	5302	5309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017285	T	6	6	15472	15477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017285	ATCT	2	8	15480	15487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017285	T	7	7	15541	15547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017285	TGT	2	6	15673	15678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017285	T	7	7	16385	16391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017285	TTC	2	6	16411	16416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017285	GAA	2	6	16445	16450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017285	AAT	2	6	17465	17470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017285	TTTTAT	2	12	17538	17549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017285	GAT	2	6	17618	17623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017285	T	9	9	18340	18348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017285	AGA	2	6	18355	18360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017285	A	6	6	18394	18399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017285	AAT	2	6	19468	19473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017285	A	6	6	19478	19483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017285	ATC	2	6	19497	19502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017285	AAG	2	6	19540	19545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017285	TA	3	6	19559	19564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017285	A	6	6	19566	19571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017285	GCT	2	6	19572	19577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017285	CTT	2	6	19612	19617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017285	TGTT	2	8	21446	21453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017285	CTTT	2	8	21470	21477	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017285	TCT	2	6	21506	21511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017285	TAA	2	6	22823	22828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017285	ATTA	2	8	22850	22857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017285	T	9	9	22869	22877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017285	T	6	6	22879	22884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017285	ATA	2	6	22885	22890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017285	TAT	2	6	22906	22911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017285	T	6	6	22911	22916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017285	GA	3	6	24902	24907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017285	TTG	2	6	24933	24938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017285	AC	3	6	24950	24955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017285	AATA	2	8	24969	24976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017285	CTT	2	6	24995	25000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017285	T	6	6	25051	25056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017285	TGAT	2	8	25072	25079	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017285	TTCT	2	8	25116	25123	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017285	AGA	3	9	25161	25169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017285	ATAA	2	8	27834	27841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017285	TATTTT	2	12	27842	27853	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017285	TTTGT	2	10	27864	27873	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017285	T	7	7	27873	27879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017285	A	6	6	27898	27903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017285	TGA	2	6	27947	27952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017285	T	6	6	27954	27959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017285	A	7	7	27965	27971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017285	TTAATG	2	12	27979	27990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017285	TTAA	2	8	27991	27998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017285	TTC	2	6	30529	30534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017285	A	7	7	30563	30569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017285	T	6	6	33731	33736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017285	AGG	2	6	33832	33837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017285	TA	3	6	33852	33857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017285	AAG	2	6	33865	33870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017285	T	6	6	33909	33914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017285	ATT	2	6	34085	34090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017285	T	6	6	34089	34094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017285	A	6	6	34446	34451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017285	TAAT	2	8	34465	34472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017285	AAAT	2	8	34489	34496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017285	CTTT	2	8	35504	35511	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017285	GAAA	2	8	35555	35562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017285	AAT	2	6	35603	35608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017285	CAT	3	9	35690	35698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017285	TAC	2	6	36399	36404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017285	TTA	2	6	36464	36469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017285	T	6	6	36478	36483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017285	TTG	2	6	39759	39764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017285	AAG	2	6	39772	39777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017285	ATT	2	6	40183	40188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017285	ATT	2	6	41443	41448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017285	GAA	2	6	41596	41601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017285	TGC	2	6	41658	41663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017285	ATTA	2	8	44640	44647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017285	GA	3	6	44929	44934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017285	TAA	2	6	44975	44980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017285	GAT	2	6	45158	45163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017285	TAA	2	6	45192	45197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017285	AG	4	8	45202	45209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017285	T	7	7	45684	45690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017285	AGT	2	6	47707	47712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017285	TA	3	6	54482	54487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017285	GAT	2	6	54497	54502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017285	AAG	2	6	54554	54559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017285	T	6	6	54597	54602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017285	GTC	2	6	54669	54674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017285	TC	3	6	54697	54702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017285	AT	3	6	54710	54715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017285	T	8	8	56371	56378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017285	TC	3	6	56607	56612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017285	CT	3	6	56631	56636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017285	A	6	6	56643	56648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017285	GAAAA	2	10	56657	56666	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017285	AAC	2	6	59670	59675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017285	AAAG	2	8	59718	59725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017285	TAG	2	6	59813	59818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017285	TAA	2	6	59821	59826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017285	AAT	2	6	59882	59887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017285	TGATG	2	10	59898	59907	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017285	G	6	6	59915	59920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017285	GAG	2	6	59996	60001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017285	TTTA	2	8	61219	61226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017285	ACG	2	6	61257	61262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017285	TTA	2	6	61379	61384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017285	AAG	2	6	61398	61403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017285	T	6	6	61470	61475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017285	TA	5	10	61491	61500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017285	CTC	2	6	61523	61528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017285	T	7	7	61545	61551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017285	T	8	8	61561	61568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017285	TTTATT	2	12	61570	61581	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017285	TCT	2	6	61652	61657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017285	TTC	2	6	61685	61690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017285	CTT	2	6	61703	61708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017285	TAT	2	6	61711	61716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017285	AAT	2	6	61741	61746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017285	ATA	2	6	61791	61796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017285	CTC	2	6	65100	65105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017285	A	6	6	66182	66187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017285	AGA	2	6	66232	66237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017285	CTT	2	6	66388	66393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017285	A	6	6	66404	66409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017285	TG	3	6	66415	66420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017285	G	7	7	69984	69990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017285	TCT	2	6	71235	71240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017285	TTTGA	2	10	72952	72961	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017285	GCATTC	2	12	72990	73001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017285	T	7	7	73004	73010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017285	GAT	2	6	73040	73045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017285	G	6	6	73050	73055	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017285	GTT	2	6	73058	73063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017285	TTTTC	2	10	73084	73093	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017285	AGA	2	6	73116	73121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017285	CGT	2	6	73138	73143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017285	AT	3	6	74414	74419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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